二〇三七年の夏。神海ヶ丘高校に通う主人公こと煌鐘 透を含む十万人は、もう一つの世界《E.a.》で日々闘っていた。 　E.a.では《記憶結晶》という殺した相手からドロップする物を集めると、一つ願いを叶えてくれるという。 　透は自身の願い——世界の真実を知る事——が一致した者とだけパーティを組み、願いを叶える為に身を投じていく。 　そんな中、同級生の桜木 遥は班の自由課題に取り組んでいる最中、ある事に不審を抱く。其れを解明する為、色々と調べていたのだが……