西暦２２１５年、混沌（カオス）元年。第三次世界大戦から約１世紀の時が流れ、人類はさらなるグローバルな科学の技術革新の恩恵を受けてこれまでに無い程に繁栄した。しかし、その一方で大戦後に国が３つに分離した日本は近年、各国民の思想｜（主に政治・哲学・心理学・宗教の面において）の齟齬からなる摩擦によって冷戦状態が続いており、その激しさが次第に増している。
それに加えて東京湾に新たに設けられた巨大な埋立地｜（通称：咲島）
に置かれた日本国｜（狭義で本州の東北の一部以外すべて）政府直属にしてグローバル科学技術のパイオニアである咲島科学技術研究所でやっかいな代物が開発されてしまった。それを巡って各国の秘密組織が暗躍し、主人公彼方や稔等を含み、たくさんの人々が事件に巻き込まれてゆく・・・。さらに、その科学技術の極地が皮肉にも生み出してしまった混沌｜（カオス：実在界が全て繋がる。つまり、この世とあの世が渾然一体となるというありえない現象のこと。）の結果、人々が直面する混乱の度は遂に人類史上最大級のものとなった。
