＜MA-CHI-NE＞と呼ばれる、『人間の傍で、人間の心の動きを制御する事に特化した知能』を搭載した様々な姿形の機械たちによって、戦争を克服した近未来。 争うことを止めた人類は叡智を集結させて、＜ネオ・シティ＞と呼ばれる都市群を世界中に建設した。 しかし、その中で、最大規模の都市、＜ネオ・ヤーク＞を管理、維持していた＜マシン＞が、突然人類に反抗を起こした。 その＜マシン＞は、生物を模したような殺戮兵器を造り出し、＜ネオ・ヤーク＞を奪還しようとする人類に立ちはだかった。 追い込まれた人類だったが、人の思念をエネルギーに変換する未知の鉱石を埋め込まれた、＜ヒューマノイド＞と呼ばれる改造人間たちが戦局を一気に変えた。 ＊＊＊ それから三年後のある日、極東支部のヒューマノイド、RK-690は"人型のマシン兵"──マン・マシーンと邂逅する。 人間と機械の行く末は、このエンカウンターから始まるのだった。 ＊＊＊ この物語は、人間と機械の狭間に立った者──＜マン・マシーン＞の物語。 そして、第二の創世記である。