高校野球連盟が女子選手の甲子園出場を認めて早数年。未だ甲子園の土を踏んだ女子選手は現れない。 それもそうだ、男と女では身体能力に違いがあり過ぎるのだ。結局野球は男のスポーツなのだと、多くの人はそう言う。 そんな世間の風潮から女子選手への差別意識は徐々に強くなり、彼女らの大半も事実としてそれを受け入れていた。 しかしそんな風潮を嘲笑うかのように、かつて偉才と呼ばれた少女は高校野球界に旋風を巻き起こす。

大切な人をただ守りたい――そうひたすら願い、研鑽し続けた少年は一本の刀を手に。 あの女が憎い――そう憎しみ続けた少年は拳銃を手に。 そして、ただ平和を願った少女は――命を手に。 少年たちは未曾有のバケモノに立ち向かう。

高等教育管理組織によって運営されている国立如月高等学校に入学した朝比奈礼人。勉強にはそこそこ自信があったのだが、なぜかバカが集まる6組に配属されてしまう。教室や寮だけでなくクラスメイトの学力も最悪という状況で果たしてSランクまで上り詰めることができるのか。