西暦2040年・・・・魔法が普及し、科学も格段に進歩したそんな世界・・・反魔法主義団体『エンドレスリベリオン』と呼ばれる組織は、魔法の存在を消す為に日々、様々な場所で反乱を繰り返していた・・・。 そして、その中の一人・・・『剣坂忉利』の物語。

東京都のとある孤島を改造して出来た学園都市・・・天海原学園都市。 そこは、人ならざる者が人と馴染む術を手に入れる為の学園だった。 そして、その学生の一人・・・不知火黒兎|(くろと)は一人の女性が転校して来た事により、運命の歯車が廻り出す・・・