謎の生命体、合成異質同体(キメラ)から トーキョーの街を護る自衛組織、 合成異質同体討伐隊(キメラ シナプス・フォース)。 16歳の少女、橘花梨はシナプス・フォースに入隊し、 合成異質同体(キメラ)と闘う運命を背負う。

僕は普遍的で平凡な男子大学生。 ある日の帰路、ある少女との出会いをきっかけに、 僕の退屈な毎日は、 狂おしく狂気に満ちた 美しく儚い日々へと変容していく。