学園都市アテナ、そう呼ばれる街で少女は目を覚ます。 そこは『ギフト』と呼ばれる異能力や『プレイヤー』という異能力者が集まり様々な分野の研究が盛んに行われる街。 エレナという自分の名前以外記憶を無くした彼女は、紫陽学園という学校の生徒会によって保護された。 しかし、それは完全な善意からの行動ではないようで、近頃学校の生徒が記憶を失うという事件が立て続けに起こっているという話を聞かされる。 エレナの状態と何か関係があるのではないか、そう疑う生徒会長の戸田柚葉（とだゆずは）と生徒会の宮矢咲夜（みやさくや）に協力しながら自身の記憶を取り戻すための日々が始まった。