桜井悠は大手ゲーム会社のディレクターとして、画期的な乙女ゲーム「Re:Start」を手掛けていた。彼はこのゲームに、従来の乙女ゲームを超える新しい要素を盛り込むことで注目を集めていた。ある夜、仕事の息抜きにコンビニへ出かけた悠は、交通事故に遭い、暗闇の中へと消えていく。 目が覚めると、悠は自分が開発中だった乙女ゲーム「Re:Start」の世界に転生していた。そして彼は、ゲームの女性主人公シエル・クライスとして生きることを余儀なくされるのだった。