魔術都市ルーセリア。人間が魔力を用いて魔術を操ることができるようになった時代。 修道院に身を置く少女ヒノキは夢を見た。かつて生き別れた兄の姿を。 ある日、その夢の中にでてきた兄と瓜二つな少年が見つかった。 記憶喪失の少年を。 当時から変わらない姿のままで。 物語は二人の再開から幕を開ける。

　リーナ・ギルバルト王女は、『灰色の瞳』を持って生まれた。『灰色の瞳』を持つ人間は、ドラゴンを使役し国を滅ぼすという伝承があり、彼女もまたそういう存在であるとされた。 　彼女は自らドラゴンを殺し、自分が普通の人間であることを証明するため、日夜剣術の修行に勤しんでいた。 　そんなある日、漆黒の竜、鎧竜《アーマード・ドラゴン》が襲来する。対ドラゴン用に用意された武器や砲弾をものともしないその鎧竜《アーマード・ドラゴン》にリーナは一人で戦いを挑むことを決意する。