都会の小さな家で、忙しいパパとママと一緒に暮らす保育園児のアオちゃんは、ある夜、自分の部屋で目を覚ました。そこで、風変わりな姿の小さな三匹の生きものを見つけた。彼らの名前は、クー、ネル、キル。ずっと昔から、自分たちの気に入った家で家事をこっそり手伝って暮らしてきた彼らは、アオちゃんのうちに住み着くようになる。アオちゃんにだけ姿が見える三匹は、ケンカしたり、赤ちゃんのお世話に手こずったりしながら、アオちゃんと仲良くなってゆく。しかし、クー、ネル、キルとアオちゃんのお別れの日がやってくる。クー、ネル、キルは、アオちゃんに自分たちの秘密を打ち明け、新しいお家へ旅立つのだった。