遠い未来。しかしながらどこか懐かしさすら感じる世界。 海賊団ザビーは、連合軍の空中船をセグと呼ばれるロボットで襲撃していた。彼らの狙いは、連合が連れ去ったとされる少女と、その少女が持つ青緑に輝く石「ラムターストーン」だった。 襲撃の最中、ラムターストーンを持った少女は空中船から落下してしまい、海賊団の一員であるガイヤは、その少女を救出しようとセグの手を伸ばす。 その時、ガイヤは少女が持つラムターストーンの奇跡を目の当たりにするのであった……。

どこでもない平穏なはずの街で、ミイラのような死体が発見されるという平穏ではない事件が起きた。 私立探偵である神藤は相棒の隼戸と共にその奇妙な事件を個人的に捜査していた。 そんな神藤には二人の引き取り人がいた。一人は真由美という女子高生であり、もう一人はヒロキという青年であった。ヒロキは神藤の手伝いをしながらここで生活をしている男性だが、彼には昔の記憶が無かった。 ある日、ヒロキは迷子猫の依頼人に猫を届けた帰り道にある女性と出会うこととなる。 その出会いが、自身の運命を再び目覚めさせると知らずに……。