神谷市で発生した殺人事件。 中堅刑事の高橋と加納、新人刑事の荒木の三人はその捜査メンバーだった。 警察上層部内だけの情報を謎の手段で手に入れてくる加納はそれが異能者によるものと早々に掴んでいた。 次々に現れる異能者たち。真っ当な捜査を旨とする高橋、異能者に執拗なまでの興味を秘める加納と荒木の三人は通常犯罪から外れ、そのまま異能者たちの探索とその謎究明の任務に就く。 異能者たちが有する異能の謎を探る中、高橋たち三人は異能者たちの力が通じない一人の少女の存在に気づく。 一方、異能者たちの存在を隠し続ける政府だが、その存在を嗅ぎ取った超大国の諜報機関はその力を手に入れようと暗躍を始める。 やがてその動きはバチカンに伝わり、突如ローマ教皇が来日する。 ローマ教皇はこの事件が世界の終わりにつながる事を危惧していた。

主人公が転移した先は日本の戦国時代。なぜだかそこは人と人が争うだけではなく、人と妖の戦いまで繰り広げられていた。 行く場所も何も無い主人公は見習い巫女として、柳生宗厳たちと妖退治に身を投じる。 京の土御門家では、若き当主 有脩が妖討伐のため、そして自分より有能と評されている妹 清子に対する対抗心から古の巫女卑弥呼を召喚していた。 卑弥呼の術を宿した破魔矢は清子の破魔矢に匹敵する能力を発揮し、その破魔矢を有脩から法外な価格で買った主人公は強大な鬼を撃退する。 その頃、土御門の家を捨てた清子は摂津、河内、大和の地を巫女姿で彷徨い、卑弥呼が妖たちを海に逃がした事を非難するために魏に送った使者がお詫びとして持ち帰った妖討滅の法具 三角縁神獣鏡を探し歩いていた。 将軍となった足利義昭はまだ覚慶と名乗り仏門に入っていた頃より亡き兄 義輝、明智光秀と共に行っていた妖討伐に引き続き精力を傾ける。 そんな義昭を妖狐に操られた三好三人衆が襲撃する。 三好勢の反乱軍を将軍方は一度は撃退するも、妖を敵視する本願寺までが三好勢と手を組み、信長包囲網を形成し、妖狐側に立って戦う事を決める。 神レベルの妖さえ封印する力を持つ三角縁神獣鏡。その使用には強大な力を持つ二人の巫女の連携が必要である。 三角縁神獣鏡を手に入れた清子は主人公たちを襲う風神を相手に三角縁神獣鏡を使用するが、もう一人の連携する巫女として、召喚された卑弥呼ではなく、主人公をその相手に選ぶ。

なぜだか気づくとねねに転生していた主人公が目指すのは信長による天下統一だったが、本能寺の変を避けようとする主人公の動きから、明智光秀謀反と言う未来を感じ取った者たちが策を巡らせ、明智光秀を謀反へと向かわせてしまった。 信長亡き後、立ち塞がるお市様、柴田勝家を力で葬り、徳川家康も力で従わせると、小田原城に立て籠もる北条をブラフと伊達政宗の白装束姿で追い込み、豊臣の天下を確実なものとした。 後は豊臣の天下が崩れるのを避けるだけ……。 だが、その天下を崩そうとする者は政権の内部にこそいた。

里見八犬伝のキャラを用いたお話です。 かつて、里見家に恨みを抱く妖 妙椿の妖力を頼りに、申世界の地より、猿族は総大将 大猿部侍伊太指揮の下、甲斐族の地に侵攻してきた。 これを里見義実は伏姫と妖 八房、そして八犬士の力を借り、打ち払うと帝位に就いた。 それから時が流れ、里見光太郎の治世、申世界では妙椿が力を取り戻し、甲斐族支配のため暗躍する。 一方、伝説の犬王の力を使えぬ日々を送る浜路姫の代わりに八房の罠にはまり、この世界に転生させられた女子高生剣士 佳奈は浜路姫として、この世を平和にし、麒麟を呼ぶ日を目指して旅立った。 明地謀反編は明地剣史郎の謀反により八犬士探しに旅立った浜路姫を少しパロディ要素を取り入れながら、姫視点で描いています。 申世界編は猿族が暮らす申世界の現状を同じく姫視点で描いています。 申世界緋村編は姫の護衛でありながら、過去に姫とそう言う関係だった緋村が少女 梓に微妙な感情を抱きながら、大猿家に捕らえられた姫を救い出す話を緋村視点で描いています。 化け猫編は緋村に秘めた恋心を抱く猿飼家の姫 松姫を新たな仲間に加え、八犬士を探す旅を緋村視点で描いています。 動乱編ではついにすべての黒幕が最終決戦に向け動きます。 よろしくお願いいたします。

大好きな同級生に好きな子がいると言う噂話に心を乱した主人公が訪れた秋の浜辺。 そこで助けた亀が提案した竜宮城での逆ハーなひと時。 それは年老いた乙姫様が、自分より若い子を玉手箱で老いた姿に変えようと言う罠。 そう見破った主人公に亀が出した代案は、好きなものの姿に三回変われると言うもの。 自分の姿を変えて主人公が得た仮初の時は……。