この世界には数十年前にフレイヤ隕石が落ちたそうだ。
フレイヤ隕石の影響を少女のみが受けて進化した。
学園総管理局初代代表井上真央から続く、学園都市クトルフの急速な発展には多くの組織の思惑があった。そうした歴史的背景から生まれた大人と少女の確執を危険視した現学園総管理局代表雨宮花音は兄へ手紙を送った。
どうか、少女たちが大人を頼れる世界になりますように───
手紙を受け取った花音の兄、雨宮志音は秘匿された島学園都市クトルフへ向かう。道中、花音の失踪を知りながらもスラング学園へと足を運ぶ。
そして、生徒、先生、大人を通じて、異質な世界を知っていく。
どうか、少女が少女らしくあれる世界になりますように───