21XX年、車が空を飛び、空の交通も整備され、第二の産業革命によって、世界の科学力が再び進化した人類。
宇宙にも進出し始め、徐々にそな地平線を開拓していった。
だがある日、そんな平穏を壊すかのように宇宙外生命体「MAU」が現れた。MAUは世界の様々な場所に飛来し、破壊の限りを尽くし嵐のように去る。
人類だけでなく、地球に住む全ての生命が脅かされる中、
人知れず現れた戦士。MAUを倒せる力を持った彼らを、一部の人達はこう呼んだ。
電脳人間"アルミス"、と。
主人公の高校二年生であり、アルミスを使役するレグリアス「菅原 紫」は、自分のパートナーであるアルミス「美虚 栄司」と共に、様々な仲間と出会いながら、真実と世界に挑む。