21世紀始め、突如世界に〝デイダラボッ娘〟という巨大な幼女たちが出現。文明社会を崩壊させると同時に、日本を異世界へと転移させた。 海には日本だけ、永遠に春と秋だけで山菜が芽吹き、謎のテロップと特殊効果が表示されるようになったその世界において、デイダラボッ娘たちは美味しい山菜を食べさせてくれた者にだけ限定的に文明を返還してくれることが判明する。 これを利用して台頭した山魔王率いる新政府〝山界〟は日本を圧制で支配。 今、それに抗うべく一人の元引きこもり高校生が現れようとしていた。

魔女狩りの狂気が吹き荒れた時代。 イングランドの片田舎コッツウォルズでジェシー・ブラウンという魔女が天地の理に反する魔術書、『高き館の王の書』を生み出した。 この非常事態に、互いに破門し合った東西両教会は極秘任務として手を結び、修道女と神父をそれぞれ派遣する。 ゲッシュの封印、書庫に眠るマンドラゴラ、大悪魔ベルゼブブの影、住人たちの不審な言動。それらは何を意味するのか？ ついに魔術書『高き館の王の書』が姿を現したとき、驚愕の真相が明かされる。

断言しよう、この暗号は誰にも解けないと。 ロンドンにある図書館の館長ジョン・フォスターは、自分を変えた約束の人との思い出を回想する。 2000年代始め。当時は毒舌な批評家として知られ、ある児童文学を批判して不評を買っていた彼は、アーサー王伝説を題材にした映画撮影の協力で訪れたグラストンベリーで、王と同名にして高名なオカルティストの友人アーサーと出会う。 知的な遊びが好きなアーサーは、まだ誰にも解かれていない暗号を発見したとして解読に挑戦してみないかとジョンを誘うのだった。 それが彼を開放するものになろうとは、まだジョンは知らなかった。

　謎の魔法少女が、ドイツの古城で新宗教により復活させられた鬼神イフリートを倒してから二ヶ月以上あと。 　〝見たら死ぬ動画〟の都市伝説が巷で囁かれる中、独自の正義感を持ちアルビノの容貌から〝フェンリル〟のあだ名で呼ばれる不良、桐堀敬雅《きりほりけいが》が法之宮第一高校に転校してきた。 　地元で有名な不良の転校に、当然、高校は大騒ぎ……にはならず。校内にはフェンリルなぞ足下にも及ばない変人が、すでにいた。 　世界最古の魔女アラディアを称するその生徒はどう見てもコスプレ女だが、透明化することで自身が扱う魔法が本物であることを証明して見せる。さらに彼女は、女警官である理田香奈々ら特殊御霊会部隊ＳＧＴとやらへの協力を敬雅へと求めるのだった。 　弱みを握られ、初めは半ば脅迫される形で応じざるを得なくなった敬雅は、まもなく魔法の法律が支配する世界で行われる悪事を目の当たりにすることになる。 　同級生への襲撃、連続不審死、偽札作り。それらの背後に横たわる、魔術の影。こうなっては放っておけないのが彼だった。 　やがて〝見たら死ぬ動画〟の裏に隠された罠を前に、方向性の違いから喧嘩別れしそうになる敬雅たち。それでも短期間で養われた彼らの信頼は、どうにか事件を解決に導いていく。

進化したAIへの反発から起きた第二次ラッダイト運動は、〝中国語の部屋問題〟をクリアし真に心を持ったロボットが肉体を得ても変わらなかった。 AIロボットとして初の同人誌即売会参加者になるはずだった美少女タイプの二人は、そこからの退場を促されたのを機にやがて亡命する。 その取材に臨む記者に、ある変化をもたらすことになるとは知らずに。

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母親の影響を受け修道女に憧れていたものの、あくまでフィクション的なそのイメージに憧れていただけの女子中学生、綾部マリヤ。 彼女はいつのまにか異世界に移動させられ、女神マリアンヌに救われた。 似合いの居場所として必要としている人々の下へ自動的に移動する転移修道院一式を与えられたマリヤであったが、実際に認識できる形で神を呼び出して魔法を使える異世界で、元世界の神を呼び出せないまま魔法を使う彼女は異常視されていく。 はたして神とは何なのか。

ギフテッドにしてタレントデッド、大人よりも遥かに頭がよくセクシー表現に特化した才能を持つが小学生なために何もさせてもらえないことに不満を抱いた天才メスガキ少女、美李奈璃里音《みいなりりね》。 その才能をいかしてパパ活で大人たちの間を渡り歩き、気ままに生きてい彼女だが、あるとき転落事故により女神の世界に転生する。 新人女神として奔放な世界改変を望む彼女は、そのテクニックで次々と既存の女神たちを虜にして成り上がっていくのだった。

これは、一度世界が滅んだ際の記録である。 2012年、突如として都市伝説上の存在〝小さいおじさん〟に自宅マンションを荒らされた高校生、南方祝馬《みなかたしゅうま》は、超常現象を起こす〝大異変〟によって、世界が昨日までとまるで違う姿になっていると気づく。 一方、異変の原因がマヤの予言の成就と囁かれる中、祝馬の幼馴染にして国際的ロボット関連企業スケーリーフット社のパリ支部研究所で働く十二歳の天才高飛車少女、詩江里聖奈《しえりせいな》はその正体と人工知能との関連に迫りつつあった。

両親が裕福なため働かないことに躊躇せず、ニート生活から家を追い出されてホームレスになっていた銀沢良太《ぎんざわりょうた》。 彼は、女子中学生の絶賛中二病な更等香愛永《さららかまなえ》と奇妙な出会いをした。 いじめられている最中に、いじめっこから堕天使を分離してくる退治するというありえない芸当を披露する愛永は、良太との共通点を見出だして別れる。 後に迎えにきた両親に病院へ連れて行かれた良太は、精神的な障がい者と診断され、しぶしぶ就労支援施設で働くことにするが、そこには、女子高生の歳になったが進学せずに先に通っている愛永がいた。 再会を果たした二人は、自分たちにしか認識できない非日常的日常生活を始めることになる。