内気で陰気で記憶喪失な女の子「繭遠彩奈」はひょんな事から、対機械兵機関「神工学園」へと入学する事になる。 そこでは、ここ数年人類を脅かし続けているナゾの機械生命体「クリオネ」に対抗すべく作られた国の育成機関。いわば軍学校のようなもの。 更にはそこに所属している生徒の多くが人間の常識を超えた力「超能力」を持ち操り使いこなしている。 崩壊寸前の世界の片隅で、今日も残された人達は運命に抗い生き続けている。 学園の仲間と共に、楽しめる訳でもないが辛くもない青春を送る、主人公彩奈の正体とは…？ 超能力、科学、メカ、あと魔術…？色々てんこ盛りで送るファンタジーな物語！