主人公の青年、小野太陽(おの たいよう)は、昔から怖がりで、幽霊や妖怪の話を聞くだけで震え上がる性格。しかし、彼には一つだけ特別な能力があった。それは「トンボのめがね」という、この世とは別の世界に干渉できるという不思議なものだった。
ある日、太陽はひょんなことから「妖精商会(Fairy & Co.)」という、もののけたちが経営する不思議な会社に出会う。この会社は、人間界と幽界のバランスを保つために活動しており、様々なもののけたちが働いていた。太陽はその会社に半強制的に連れて行かれ、半ば強引に社員として働くことになる。
最初は怖がりながらも、次第にもののけたちとの交流を深めていく太陽。彼は「トンボのめがね」の力を使って、もののけたちの問題を解決したり、人間界とのトラブルを調整したりする役割を担うことになる。彼のまわりには、興奮すると言葉がウチナーグチになり何を言っているのかわからなくなる豚の妖怪、心の中を読むことが出来るサトリ、そしてオネエ言葉を操るのっぺらぼうなど、個性豊かなもののけたちが揃っていた。
太陽は次第に自分の能力を活かし、もののけたちとの絆を深めていく。時には笑い、時には泣き、仲間たちと協力し、困難に立ち向かいながら、次第に自分の怖がりな性格を克服していく。
この物語は、怖がりな青年がもののけたちとの交流を通じて成長し、面白おかしく困難に立ち向かう姿を描いた、心温まるファンタジーです。