西暦2010年 突如、空から飛来した奇妙なバケモノ【異獣】により人類は蹂躙されていった。 しかし、人類も黙っている訳ではなかった。 異獣の身体をベースにした巨大ロボ【魔装兵器】を作り上げ反撃の狼煙を上げた。 それから20年後の西暦 2030年。 魔装兵器への適性が認められた【千鳥 玲名】は同じく適性があるとみなされた【篠原 萌夏】と共に魔装兵器訓練学校、謙、実働部隊。通称【魔装学園 ヴァルキリア】に入学する…… この世界で少年少女達は何を見てどう選択するのか。