都内某駅は突如として起きた謎の局所的地殻変動によって異様な姿に変貌し、ダンジョンと化してしまった。 高次元との接触で生まれたそのダンジョンは既存の物理法則が歪み、 中に充満する不可視の”瘴気”は、適合しない人間にとって致命的なものとなる上、 異形の化け物が跋扈する危険に満ちた世界だったが、同時に新たなエネルギー、鉱物資源をもたらすフロンティアだということも判明した。 数年後、日本は適合者を公務員としてダンジョンに派遣し、探索と採掘を進めるようになっていた。 そんな中、適合レベルとしては最低ランクの作業員「阿内 翔（あない しょう）」は採掘作業中に発見した深層まで届く縦穴に誤って転落、命を落としてしまう。 だが、今際の刹那、翔の意識に語りかけてくる”声”があった・・・