やっとの思いで残業を終わらせた仕事帰り、通り魔らしき男に刺されて死んだ主人公、ヤマト。死後、他に選択肢のないヤマトは『滅亡寸前の世界』へ転移するが、そこは異能を使える人間がいる世界だった。そこで出会った世界最強の異能を持つという男は、何故か初対面のはずのヤマトを知っているようだった。転移した先で出会った者たちにより、ヤマトの隠された過去や運命が明らかになってゆく。ヤマトは世界の滅亡をとめることはできるのか？

ある日の授業終わり、ボールペンを落とした西田。通りかかった結城にボールペンを拾ってもらったことをきっかけに西田は不思議な夢を見るようになる。