高校2年生の桐生晴翔は、天才だけど少し抜けている発明家・博士の作るゲームのテスターとして、これまで何度もゲームをプレイしてきた。そんなある日、夏休み前の教室で博士から届いた一通のメール──「ついにあれが完成した!」
完成したのは、世界初のフルダイブ型VRMMORPG《エターナル・オデッセイ・オンライン》。
だが、いつものようにテストを開始した博士の助手・如月結菜がログアウトできなくなるというトラブルが発生していた。解決策はただひとつ──ゲーム内に君臨する魔王を討伐し、強制ログアウトを発動させること。
命懸けのデスゲームではない。死んでも街で復活できる。ただし、死亡すればレベルが5下がるデスペナルティ付き。
博士に頼まれた晴翔は、幼馴染の美月、親友の蒼真を誘い、結菜救出のためにゲームの世界へとログインする──!
果たして、無事に魔王を倒し、彼女を助け出すことができるのか?