日本人が政治参加の権利を持つ一級住民と政治参加の権利を持たない二級住民とに分けられて生活している日本列島。 ベテラン潜入捜査官ジミー・スズキはかつて自分の相棒だった者のクローンの追跡を行なう任務に就く。 この任務でジミー・スズキは小林良太郎、藤田直美、吉田真冬、山本治という若者達と出会い、そして忘れられない経験をすることになる。 一方、時を近くするもう一人の潜入捜査官アキラ・ナカジマは異能力を持つ少女と協力して、ある一人のロシア人を捜し出す破目になっていた・・。