巷で天才脳科学者と称される21歳の大学生、夜野美月（よのみつき）。身体に障害を持った幼馴染の古閑敬太（こがけいた）の為にその頭脳を活かして来たが、結果的に現代科学に大きく貢献する事になっていた。そして今、彼女は敬太の為に脳科学の未知なる可能性に足を踏み入れる。その名は自律思考型プログラム「ATTP」――。