高校二年生の少年、時詠　零時（ときよみ　れいじ）は、ボイスレコーダーで日記を付ける事が趣味の、引きこもりがちな少年であった。 　ある日零時は、部屋の中の食べ物が無くなったため仕方なく外出をする事になる。 　その時、昨日に隕石が落ちた公園の辺りから、強烈な閃光が発せられ部屋の中を包んだ。 　零時は一瞬その閃光に驚くも、あまり気にする事無く玄関の扉を開いた。 　しかしそこで零時が目にした光景は、零時の知っている世界では無く、ただ荒れ果てた景色が広がっている全く別の世界…『時間外世界』であった。 　いきなり違う世界に迷い込んで戸惑っている零時の前に、一人の少女が現れる。 　その少女の名は零（れい）……零時は零から、この時間外世界の真実を教えられる。 　時間外世界では時間の概念が無い事、この世界は『ゲームマスター』という神に近い存在が作った世界だという事、この世界には零の他にも、別の平行世界にある別の地球から来た四人の少女がおり、最後の一人になるまで戦わされている事、それらの事情を聞いた零時は、零と共に時間外世界から二人で助かる術を探していく事になった。