夏休みに数学の補習を受けるはめになった三芳和磨は 気だるそうに教室に入る。 しかし、数学教師に配られたプリントには補習とは全く 関係ない問題文が書かれていた…

「女だけの集落」があるという噂を聞きつけた とある大学生は、予備校に通っている友人を連れて その集落があるといわれる離島へと向かった…

<i137843|13713> 　私立歩学園には『怪盗Ｘ』と名乗る泥棒が時折出現する。欠席中の生徒の私物を盗み、犯行声明としてバツ印を書いた紙切れを現場に残していく。そして盗んだ物は後日、持ち主の手元に返す。犯行目的と正体の一切が不明。しかし『怪盗Ｘ』の出現は生徒の間でたちまち話題となり、いまや注目の的。彼の記事を学校新聞の一面に掲載している新聞部も鼻が高かった。 　しかし、とある好敵手があらわれる――。 　２年Ａ組の女子生徒、菊池五巳(いつみ)。通称『落し物係り』と呼ばれている彼女は校内における生徒や教職員の紛失物を論理的思考で探しあて、落とし主に返していることで知られている。夜通しゲームに没頭するのが日課の変人。 　担任の教師の依頼で『怪盗Ｘ』を捕まえることになった菊池五巳は、まず新聞部副部長の遠藤吉平に疑心の目を向けるのであった。