過去に起きた謎の大規模な地殻変動により、その形を大きく変えてしまった日本。地殻変動がもたらしたのは地図の書き換えのみならず、気候や文明さえも闇に葬り去るに至った。 その謎と夢で見た生き別れの少年”天舞クロス”を探す旅に出た”オツシュウ”出身の少女”阿佐美カナ”は、クロスによく似た少年”リト”によって謎解きの鍵となる”蒼い遺伝子の発現者（グレゴリアン）”に目覚め、世界再生と少年との再会の希望を古本と共に未来へ託す。 日本の南方”ヘイシュウ”に住み、新たに古本を受け取った青年”伊集院ダイ”は、最早外の世界に希望も興味も抱かない引きこもりであった。

過去に起きた謎の大規模な地殻変動により、その形を大きく変えてしまった日本。地殻変動がもたらしたのは地図の書き換えのみならず、気候や文明さえも闇に葬り去るに至った。 その日本の北方”オツシュウ”にある町に住む少女”阿佐美カナ”は、夢で見た生き別れの少年”天舞クロス”の存在を信じて、唯一過去の日本について記された古本と地図を手に、不毛の大地へ小さな一歩を踏み出す。 少年との再会と、世界の真実へ近づくにつれ、幼い少女は曖昧な記憶に隠されたカラクリと日本に眠る不思議な力の存在に気づいていく―。