西暦2055年。日本、東京。約10年ほど前、東京に人を襲う怪物が「喰人鬼(グール)」が現れた。グールは、次々に人間を襲い東京はパニックに陥った。そこで政府は、治安とグール討伐を目的とした組織「治安維持組織」を作り上げた。グールは人間を喰らうだけではなく、中には人間をグールに変えるのもいた。グールになるのを防ぐためには、ワクチンを打たなければならい。そのワクチンの開発と研究、グールの討伐をを組織に任せた。が、グールの数はどんどん増え被害は年々大きくなっていた。そんな中、将来、治安維持組織へと入る科学者や戦闘員の卵を育てるための学校が政府によって創立された。そこに通う少女真はある日、グールに学校が襲われてしまう。大切な者を守るため、戦うことを決意する。