世界樹プロジェクトという人類救済措置が失敗し大災害が起こり汚染されたと言われる世界、大気と土壌の異常により大きく育った木々の中に建つ、人類に残されたされた最後の楽園『コクーン』。 『コクーン』は本当に楽園なのか？今、『コクーン』の崩壊がはじまる。