普通の高校生活を送っていた主人公の萩飛鳥(はぎあすか)。そんな時、突然校内で噂話が広がる——『幽霊列車』。どうやら、彼の好きな女の子綾部雪(あやべゆき)が関係しているみたいで——。好奇心旺盛な友人の諏訪部龍二(すわべりゅうじ)に連れられ、もう一人の友達、利根川誠斗(とねがわまさと)と一緒に、夜中出掛けることに・・・。３人がそこで見た光景とは？！