都内の有名大学に通う「僕」は、ある日飲み会の帰りに泥酔して、駅のホームから転落してしまう。目を開けると、目の前には「モグラ男」を名乗る男がいた。彼が、「僕」を助けたのだという。 地下鉄のトンネルに住むモグラ男は、「僕」を大事な人を探し回る旅に連れていく。振られた元カノ、いつも強気の親友、関係の冷え込んだ父親。 地下鉄の迷宮を巡るうちに、「僕」は人生について考え直すようになる―。

舞台は近未来の東京。父親の研究所に住む少年アキは、ある日研究所に訪れたカラスの群れをきっかけに、自分の出生の秘密を知る。事実に衝撃を受けて外の世界に飛び出したアキは、不思議な少女チェシャ猫と、「血と鋼の同盟」を名乗るならず者集団に匿われる。彼らは、アキの父親に実験台にされていた元被験者たちだった。「アキの父親に復讐する」と語るチェシャ猫に協力を約束したアキは、隠れ家での生活を始めることになる。

大学に入ってテニス部に入部した「僕」、中村博。テニスが好きで始めたはずの部活は、いつしか苦痛となり、日常は色褪せていく。勝てない試合に、どうして挑み続けるのか？　得意でもないことに、どうして拘り続けるのか？　仲間がそれぞれの決意を固めるなか、「僕」はもがきながら、答えを探す。