使い魔使いを目指す、主人公の桐生理央は魔力が平均の1万分の1。魔法は1つも使えず、あるのは小さい頃にほんの少しだけ習った剣のみ。 理央は超ギリギリで使い魔学校に合格し、入学式の1ヶ月後、今日中に使い魔との契約を結び、明日連れてくるように言われたので、触媒にチョコレート！ 召喚した使い魔はSSS級！その瞬間から理央の平和は崩れる。理央は生き抜くことができるのか。この過酷な、世界で…

ある日、茨樹東高校の2年4組は全員、異世界召喚された。女神はこの世界を救って欲しいと言いひとりひとりに《力》を与えた。 主人公であるハルは面倒だと言い、放棄しようとするが、美少女のカナと出会い（彼の言い分では）仕方なく異世界攻略を開始した。 この時彼は予想していなかった。過酷な選択を余儀なくされることを。

X107年第一次聖戦が起こった。人類は暗黒軍の進軍に為す術もなく敗北した。その様子を見たゼウスは魔力を持つ人々に神々の力を秘めた印、《神装印》を与え、暗黒軍に対抗出来る力を授けた。 そして現在、主人公水蓮寺刀夜は、【戦争学科】しか存在しない、『聖命学園』の第二学年で学園中ランキングは最下位の生徒。そんな彼は様々な人々と出会い、戦う理由を見つけ、戦争を終わらせるために、そして大切な人を守るために力を振るうことを決意した。