五十年という永い眠りから覚めた主人公、碓氷創壊（そうかい）は、ちょっとした好奇心で、地上に出てしまった。そこは、彼の知っている日本とは程遠い、荒廃しきった日本だった。彼は、自分が知っている日本を取り戻すため、荒廃した日本を舞台に、奮闘する。