いつもと変わらない日常を送っていた青年。遠山十兵衛。十兵衛はある日突然、異世界の森に落とされてしまう。そこで出会ったのが『絶滅種』であるドラゴンだった。しかし、この世界のドラゴンは全てあらゆる手段を講じても死んでしまう。生まれた瞬間に『死』を定められた運命をもつ。それが『絶滅種』の運命だと言われていた。それを覆すべく十兵衛は現代知識を駆使してドラゴンをこの世界に顕現させる。 その瞬間から世界が十兵衛とドラゴン達を中心に周り始めた。