主人公、月影未蘭〈つきかげみらん〉は運動は駄目、勉強はそこそこの魔術学校２年の生徒。ある日校長先生の一言で、黒咲百合奈〈くろざきゆりな〉孔龍朱雀〈くりゅうすざく〉とチームを組むことになった。チームと過ごす日々が多くなるにつれ、だんだんと戦争の核心に触れることになってしまった―。