――あなたは算数を食べたことがありますか？ 　小学五年生の島本菜奈（しまもとなな）は今日も塾の講師に怒られ、塾をやめることを考えていた。そんな彼女を見て、友人の美雪はレストラン『シャンボール』の噂を持ちだす。 　シャンボールの噂。それはシャンボールが算数や国語などの「教科」を調理してくれるレストランで、算数でできた料理を食べた者は算数が得意になる、といった学生にとっては夢のような噂だった。 　招待状を受け取った奈菜（なな）、順平（じゅんぺい）、音色（ねいろ）の三人を待ち受ける運命とは？