「魂」を材料に造り出されし神器《アーティファクト》。アーティファクトの製造者で世界終焉へを企てる「ショキア」。 そして、唯一アーティファクトを破壊できる冥器《アクノロギア》に選ばれた存在である、「別れを知った者」達。主人公「ユージ」もその一人であった。 ユージは家計とアーティファクトに縛られた魂を救うべく、仲間と共に険しい戦いが始まろうとしている。

数少ない世界樹の森で動物たちとひっそりと生活を送るツバサと、その幼馴染のユメ。争いもなく平穏な毎日を送る２人であったが、ある日突如として現れた「悪魔教」に故郷を襲撃されてしまう。故郷や仲間たちを守るために奮闘するツバサであったが、突然天神としての力が芽生え、自分は天族だということを知らされる。過去に自分に何があったのか、すべての謎を解いていく物語が始まろうとしていた。